Llevó la batuta de la Orquesta Sinfónica Nacional de México, con la que realizó gira de nueve conciertos por Alemania y Austria, en salas como la Wiener Musikverein, la Großes Festspielhaus de Salzburgo, la Kölner Philharmonie y la Alte Oper de Fráncfort.

Completó once temporadas como Director Musical de la Orquesta Filarmónica de Luisiana (LPO), con la que emprendió una auténtica renovación cultural de Nueva Orleans tras el huracán Katrina. La incorporación a la LPO de los violinistas de renombre internacional Joshua Bell y Augustin Hadelich, y el violoncelista Yo-Yo Ma, son una prueba de la influencia artística de Prieto.

La temporada 2017/18 de Prieto incluye actuaciones en Europa, América del Norte y del Sur y Nueva Zelanda, e incluye debuts con la Orquesta Filarmónica de Londres y Los Angeles New Music Group.